我覺得應該是 WD 的硬碟 + Windows 2000(或XP) + FAT32 才會出現有時格式化失敗，之前用 WD 1200JB 120GB(8MB)就出現無法格式化 （分成8GB+110GB）
現在用 Hitachi 120GB (8+110GB)+ windows 2000(或XP) + FAT32 就沒這樣的問題
PS 我有兩台電腦一台是 windows 2000 一台是 XP

****FAT32最高可支援127GB，建立好以後，還是用磁片重開機，在DOS底下Format。如果要格式化一顆磁碟分割，超過128GB或以上，真的只能用NTFS了。*******

其實還是可以用 FAT32 + >127GB
只不過資料何時會不見就不知道
之前用 Hitachi 180GB (分成 15 GB+ 165GB)
硬碟三不五時就幾幾叫，半個月後
有一次要播放 放在硬碟中的影音檔時
就出現檔案損毀，最後重新開機
一開機就進入類似 DOS 畫面
然後就一排以 Deleting 為首的指令不斷出現
160GB的資料，在重新開機後
只剩不到 6GB
現在 WD 1200JB 及 hitachi 180GB 都用 NTFS

結論：
1.WD 硬碟盡量別用 FAT 32 (不論容量多少)
2.若單一partition > 127 GB 就別用 FAT32

Win98的FDISK.exe原始版本在計算 >64GB的硬碟容量時會算錯
容量會算成[ 實際容量 - 64GB ]
M$有放出新板的Win98 FDISK.exe
但是能分割的硬碟容量上限為127GB

Microsoft KB 263045: Format displays size of partitions larger than 64 GB incorrectly

另外用開機片開機一概稱呼為DOS是不正確的觀念
Win98開機片開機就是Win98的CLI，WinME開機片就是WinME的CLI
FDISK.exe、FORMAT.com、...等程式版本都不一樣,也不能互通
比如WinME的FDISK.exe就可以正確計算、分割 >64GB的硬碟
但是直接把WinME開機片裡的FDISK.exe放到Win98開機片則不能通用...
WinME的FDISK.exe有最大512GB paritition的限制
但是用WinME安裝磁片(光碟)分割則沒有這個限制
Win2K/XP分割和format FAT32 partition的上限是32GB

另外Win98似乎有127GB partition(FAT32)的限制
目前所知是SCANDISK.exe等程式在>127GB partition上會發生錯誤
WinME/2K/XP則能夠達到FAT32的極限(2TB)

Win98原來的FDISK.exe仍可以使用，只是容量顯示不正確，但分割完成並格式化(FORMAT)後可在作業系統(WINXP)下，見到正確的容量顯示。

個人經驗是當FDISK.exe要求輸入分割磁碟容量時，可以輸入百分比值，這樣當完成分割與格式化後，一切就沒問題了。