請教大大們

小弟想做轉檔的工作,可是用TMPGEnc來執行後,卻發現轉檔不完全(沒轉完),後來用AVIcodec與media player classic來check該影片的總播放時間,結果發現TMPGEnc轉檔的總時間恰等於AVIcodec(61分鐘),但是原檔用media player classic來看(78分鐘),TMPGEnc轉檔影片的後面的確是還有將近十幾分鐘的影片可看啊?請問大大們是否曾遭逢此類問題呢?可否建議小弟要用什麼軟體或其他方法才能連後面的那段也可轉檔成功呢?謝謝!