哈哈哈
果然有個人跟我一樣遇到一樣的問題
你的版本應該是數x版的吧~~~

我當初轉也是遇到這樣的問題
數x版的把主題曲的動畫切掉一小段 改放一個圖(上面寫北斗神拳)
我當初試了幾次都無法影音同步
不過後來利用smartripper的分章節來擷取(一話一話擷取...)
但是字幕又要去改時間碼
很花時間 因為要去計算字幕什麼時候開始....

最後只好放棄
拿一台dvd player播放直接輸入成mjpeg的avi後丟給tmpgenc壓...
因為算來算去 上面處理的時間跟拿一台dvd player播放後輸入所花的時間差不多...
但是播放直接輸入的時候不用動腦筋.....還可以邊轉邊看....