就你的問題回覆;
你的需求
CMS(Wordpress、Joomla!....)
對方開價
MySQL安裝--2000元
phpMyadmin--2000元
Apache+PHP升級--2000元
基本設定費--1000元 (僅基礎設定，調校由網頁設計公司負責)

我覺得合理
如果你說有每年幾萬的維護合約，這些應該要包在維護合約中免費裝到好，那應該要修改合約內容，或是重新簽約