簡單地說，「我思故我在」，只是在說明，
無論如何懷疑，最終得預設「思想」本身是存在的。
而「諸行無我」，說的是，不要在做事的時候，起了分別心，有了對於「我」的執著。

這兩者有沒有衝突？
從做思想活動的觀點來看，笛卡兒的說法和「諸行無我」的說法都預設了，
「至少」做思想活動的主體都是存在的，這種「存在」是概念上的，
就此而言，是沒有衝突的。
但是做思想活動時，意識到「有一個思想主體存在」這個想法，
從笛卡兒的說法來推論，這是真實的，
而從「諸行無我」的說法來推論，這是虛幻的，
這裡就產生衝突。

問題是，笛卡兒只是要找一個思想活動中「清楚而明晰」的概念，進而認識世界，
而「諸行無我」是要避免把虛幻的當真，
既然無論如何我們都會像笛卡兒一樣認為有這樣一個概念，
那麼，唯有認識在行為中做決定選擇而有所偏好的「我」這個概念是虛幻的，
才能進一步從「有我」和「無我」的爭論中跳脫出來。

可以這樣看，「諸行無我」先肯定了笛卡兒的說法，然後進一步地批判了笛卡兒的說法，
至於最終是「有我」還是「無我」？都不是！有這樣的想法就是有分別，
又預設了「我」，這樣應該就可以看出為啥笛卡兒發現這東西無法懷疑，
而「諸行無我」卻一直想幹掉它。