問題終於找到。

照 Yusunu 大的建議，用 Feature Tool 檢查了一下之後，依然沒有多大的改善。

之後，又到 BIOS 中看看有啥可以調的。
看到一個選項 IDE Devices Configuration -> SATA Mode ->[RAID]
想說並沒有用到 RAID 功能，就把它關閉，變成 [IDE] 。
沒想到改完後，速度大幅提升。
(雖然也不是多漂亮啦..)