小弟是認為沒問題啦，事實上大家常常在不同的檔案系統上存放、傳遞資料，
您沒注意到嗎？常見檔案系統如下•••
CD→CDFS
DVD→UDF
快閃碟→FAT32，有沒有NTFS小弟不知道。
軟碟→FAT
硬碟→FAT32、NTFS
而通常是媒體本身有問題﹝刮傷、壞軌等等﹞才會讓資料壞掉吧？

要是您不放心的話，把新硬碟用NTFS格式化後，先用Copy的方式移資料，
再比較兩邊就知道有沒有問題了，基本上NTFS會比FAT32可靠，
所以新的Windows才都以NTFS為預設檔案系統，
聽說下下代Windows又會帶著新檔案系統「WinFS」面世。

對了，重申Win98/Me是不支援NTFS的，拿NTFS格式化的硬碟給98/Me讀，
它會表示這個硬碟尚未格式化喔。