建議你用939的歐，754請不要考慮，這種東西很吃記憶體頻寬，還是要考慮Intel，雖然我沒用過那種軟體，不過也有用過matlab，繪起圖來覺得Intel快了一點，畢竟這種東西不是玩遊戲，需求不同，我開兩份清單你參考看看：

方案一：
K8 Athlon64 3200 盒裝 5750 元
主機板建議你用Nforce 4即可，3也可以啦，大摡4000元
威剛DDR 400 512mb*2條大約4000元左右，時價
顯示卡建議買nvidia的來做軟改，會比較好....大約是買6200或是微星5700SP這兩款，軟改之後其實跟顯示卡等級不是很有關係，買6600改起來也是同型號，看你啦，這個大該要4000左右
機殼跟Power預算兩千，買300瓦即可。
剩下的買一台DVD rom建議買pionner
硬碟買hitachi 7K250 80G sata 大概2000元
大約22000，實際狀況由於顯示卡的介面關係會有調整，這要看你的決定再來選擇。

方案二：
P4-3.0G 盒裝 / LGA775、FSB800、L2-1MB 5800元
華碩P5GD1 Pro配上PCX 5750的搭配----->不知道還有沒有賣，有機械科同學配這樣我絕得還不錯
7000元
威剛DDR 400 512mb*2條大約4000元左右，時價
連鈺C320 1000元
冰山美人 1500元
剩下的買一台DVD rom建議買pionner
硬碟買hitachi 7K250 80G sata 大概2000元
大概也是兩萬出頭

還是你要省一點的超頻版----------------->要超頻歐
賽揚D 2.4 超頻到3G多 2500元
P4P800-X 2500元
微星5700SP 3000元
威剛DDR 400 512mb*2條大約4000元左右，時價
連鈺C320 1000元
冰山美人 1500元
剩下的買一台DVD rom建議買pionner
硬碟買hitachi 7K250 80G sata 大概2000元
大約16500可以配完，見我的簽名檔，我也是有跑一些繪圖的，因為上次那台跑Hspice很慢....線條等好久，偏偏我又是完美主義，取很多點...實在是..。後來換簽名檔的配備就順多了。但是還是想換顯示卡變成微星5700SP，因為感覺nvidia的跑OpenGL比較快...