我前陣子也裝過差不多的:

MSI KT6V-LSR
散步龍2400+
MSI NVIDIA 5200------>憾訊9200se
創見512 DDR400

裝完灌系統開機一切都很順暢,不過你的問題我自己的電腦也遇過類似的問題,說出來我自己都覺得很扯....我的是顯卡的D-Sub或DVI接頭有碰到機殼就會出現各種怪現象,我還連BIOS都進不去,詳細狀況請參閱:http://www.pcdvd.com.tw/showthread.php?t=391658

也許是某個地方有短路吧