針對標題而言：

硬碟廠商網站應有相關資料可供查詢，以 HGST 的 Deskstar 7K400 為例：

Deskstar 7K400 hard disk drives specifications
網頁：http://www.hitachigst.com/hdd/support/7k400/7k400.htm

Environmental characteristics
　Operating (工作中)
　　Ambient temperature 5° to 55° C
　　Relative humidity (non-condensing) 8% to 90%
　　Shock (half sine wave, 2ms) 55G
　　Vibration (random (RMS)
　　　　0.67G for horizontal
　　　　0.56G for vertical
　Non-operating
　　Ambient temperature -40° to 65° C
　　Relative humidity (non-condensing) 5% to 95%
　　Max. wet bulb (non-condensing) 35° C
　　Shock (half sine wave, 2ms) 225G
　　Vibration (random (RMS) 1.04G rms (XYZ)

這應該算是硬碟目前使用機械結構的天性：「工作時，垂直 (0.56G) 比水平方向怕震動 (0.67G)」。

對了，如果您的 5.25 還有空位，是可以去買個 3.5" > 5.25" 轉接固定座。

不過，您若妥善固定或防震，這個因素應該不太可能顯露出來。 有時候除了萬全防護之外，運氣成分似乎也是一個因素...

(edited: 改 7K400 + 網頁連結)