其他網友補充
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和樓主所見略同。

有几點理解不太一樣。說一下。
1.李心儿和陳永仁幽會那一幕，實際是陳永仁的幻想。李心儿說陳永仁有妄想症，這是為劉建民以后的妄想症給出一個伏筆。

2.有一個非常重要的情節，就是劉建民偷了李心儿的電腦，并得到了陳永仁的治療記錄。在另一幕中，李心儿要陳永仁對他坦誠。結合這兩處，我認為陳永仁确實在后來對李心儿說了實話，（包括了戲中陳永仁的所有情節，都向李心儿袒露，被記入醫療檔案）只是沒有露自己的警察身份，而這些檔案又落入劉建民的手中。因而在劉建民看過檔案后戲中陳永仁出現的所有場景其實都是劉建民（幻想為陳永仁的身份）的回憶。（后面具体解釋）

3.劉建民并非是在撞車后才出現妄想症的，而是一點點發作的。
①記得李心儿的電腦被偷以后，劉建民來到現場离開時說的“過了明天就沒事了”，而劉建民与李心儿上一次見面時，李心儿才對劉建民說過：陳永仁死前說“過了明天就沒事了”。這應該是劉建民初次發作。
②劉建民回憶到自己（作為陳永仁）在圖書館看到楊錦容与韓琛接頭后，他接到一個電話，里面是陳永仁的聲音說：“老板，今天看到楊錦容与韓琛見面，楊錦容可能是內鬼，你察一察”。大家應該記得陳永仁在片中叫黃志成老板，那此時劉建民明顯以為自己是黃志成了（病開始重了）。然后劉建民感到眼睛不适，�**籈帣棺銵]此時鏡頭突然加快也是一种暗示），這個他自己熟悉的動作讓他又回到劉建民本身的意識。然后李心儿打電話來說：“你剛才怎么不說話？陳永仁寄了帶子給我”。說道這里大家應該明白了，陳永仁的那個電話是劉建民的幻覺，實際上是李心儿打的。
③車禍應該不是劉建民故意的，出事前有一個极短畫面切換：陳永仁用槍指著劉建民的頭。我覺得應該是此時劉建民幻想自己是陳永仁，并用槍對著劉建民，這個幻覺造成了車禍，然后劉建民繼續幻想他（作為陳永仁）和劉建民、黃志成在一起。當他幻想到陳永仁用槍對著劉建民時，李心儿走過來，正好看到劉建民站在陳永仁的位置上，做著陳永仁的姿勢，然后又回到劉建民的位置，此時劉建民應該回到自我了。但李心儿一句“知不知道你剛才在做什么”估計讓劉建民想到陳永仁的那句“我有沒有做過什么？”結果再次進入陳永仁的狀態，因此有了牽手的動作。由此看來，劉建民的妄想症是多個原因造成的。A.強烈想做好人的愿望 B.急于想抓到內鬼 C.李心儿為陳永仁做的檔案中也包含了李心儿對陳永仁的催眠過程，劉建民在查看陳永仁的檔案過程中，漸漸被催眠，開始以為自己是陳永仁。 D.如樓主所說，車禍沖擊大腦。E.其他……暫時想不到

4.李心儿并沒有去算計劉建民，更沒有催眠劉建民。李心儿在劇中的作用就是用來聯系劉建民和陳永仁的這种幻想關系，也是導演怕觀眾看不懂所給出的一條線索。實際上，車禍后劉建民送李心儿回辦公室，那里出現的“雙人催眠”是導演對觀眾的暗示，即告訴觀眾劉建民在把自己幻想成陳永仁。把兩人擺在一起還有一個意思就是……

5.劉建民在李心儿的辦公室其實并沒有說出自己的秘密，實際上那是幻覺，他說出口來的應該是陳永仁在這一幕里說的台詞，所以李心儿的臉上有惊异的神情。兩人擺在一起有一個意思就是，李心儿發現到劉建民在說和陳永仁一摸一樣的話。而李心儿發現劉建民的妄想症情節應該實在最后看了劉建民在短信里說“過了明天沒事了，我一定會親手逮捕劉建民”的時候，你可以仔細看看李心儿此時臉上的表情明顯是一下明白了什么。

6.從劉建民幻听了李心儿的電話這點來看。劉建民在楊錦容辦公室找到的帶子是自己和韓琛的帶子，听到楊錦容和韓琛的對話也是幻覺，而幻覺的內容是從陳永仁的檔案中看到的。而不是倒帶的問題（因為他在妄想症的同時，各個人格自己的邏輯并沒有問題，所以他應該不會范這种低級錯誤）。

7.在沈沉放了他（劉建民）与韓琛的錄音后，劉建民本來是回到自我了的。從他說“我只想做個好人，為什么不給我机會”就可以看出來。可惜楊錦容的一句“對不起，我是警察”讓他想起了陳永仁說過的話，結果又進入幻想自己為陳永仁的狀態，一下認定楊錦容是內鬼，形勢又危急，結果只好魚死网破，兩槍干掉了楊錦容（死得真冤）。看到楊錦容頭部中彈的樣子讓他想起陳永仁，結果勾起他繼續（作為陳永仁）回憶，回憶的內容正是楊錦容、陳永仁、沈沉三人結識的場面，此時劉建民終于明白楊錦容不是內鬼，而是自己……

我不明白的是，他向自己開槍的時候，到底意識是劉建民的還是陳永仁的呢？如果作為劉建民，他是怎么想的？因為悔恨，還是絕望，還是想贖罪？作為陳永仁他又會怎么想？

8.最后，劉建民在輪椅上“你來了”應該是對韓琛的老婆說的，那一槍的意思是說劉建民的意識從此死了，以后只是一個被虛假的陳永仁的意思支配著的軀殼。

9.終于听懂了，陳永仁在最后說的是：吃完早餐吃午餐，是不是想吃*元寶蜡燭*。哈哈哈……

以上是對樓主的補充。沒有認真整理過思路，可能會有遺漏的地方。目前看了三遍，繼續看下去應該還有發現。