真的寫得很用心，平行母體理論比較少人提到，雙層母體倒是很多人在談，至於南柯一夢也有頗多人有這種想法。

其實母體是什麼？姑且不管虛擬與實際的話，不過就是一個世界吧。差別就在於目的，所謂的電腦母體就是創造出一個虛擬世界，讓人類生存，藉由人類生存時所發出的生物能量，提供機器人們使用。

平行母體理論好像是說，錫安是造物者創造的另一個母體，確實錫安是另一個世界，也是造物主所誘導出來的，但他卻不能算母體。所以平行母體理論只能算對一半。如果平行母體理論是正確的，造物者就不需要派大批烏賊去消滅錫安，直接程式碼改一改，就會像被電腦人附身一樣，變成造物者要的模樣。

雙層母體跟平行母體的關鍵差別在造物者不同，所以白鬍子造物者老頭要消滅錫安，需要實際的烏賊大軍，而錫安的造物者就不需要，也是直接程式碼改一改。關鍵來啦！如果是雙層母體，那第二層錫安的造物者目的是什麼？第一層的母體是要人類當電池，第二層如果也是，那就不會讓錫安的人大量滅亡囉！要機器人當電池？編劇應該不會這樣編吧！

至於南柯一夢，任何一部片都可以是這個結局，完全沒有破綻，因為電影本來就是夢想的呈現。只是，一定會被罵死。要接的話，一定會從第一集尼歐在電腦前睡著那裡開始接。

還有少部分的人認為跟尼歐異常腦電波有關，也就是念力之類的，這個結局基本上也不會有什麼破綻，不過這種結局在一、二集裡面都沒有埋伏筆，而且會把整部片帶向玄學的方向，以科幻片來說，算是不好的結局。

我個人認為能夠利用的伏筆在史密斯，只是要怎麼用才妙？那就要看編劇的功力了。如果從電腦的角度與網路的發展史看，加入遠端操控，是頗符合網路發展史的。

當史密斯在複製艦隊唯一倖存的那個光頭時，尼歐為什麼能在夢中看到？劇中說，因為史密斯跟尼歐有某種關連。第一集是尼歐鑽進史密斯的身體裡，以看似吸收的方式，破壞了史密斯，導致史密斯有了複製的能力。吸收V.S.複製，有什麼關連？還有烏賊來的時候，尼歐說他感覺到了，為什麼他可以感覺到？史密斯利用那個光頭進入了錫安世界，尼歐是不是也可以利用同樣的方式進入母體世界？第二集多了很多寫程式的劇情，也就是說，尼歐能不能在史密斯或者母體身上寫了一個程式，類似遠端操控的東西，直接從錫安世界感應母體世界，或者當他有預知能力時就已經有了這種遠端操控能力，只是當時只是剛開始單向的遠端接收能力後來升級之類的？

想要把烏賊關掉，除了像艦艇一樣發出電磁波外，母體有沒有辦法辦到這件事？如果有，那尼歐藉由遠端操控與母體取得聯繫，進而控制烏賊，這是合邏輯的。重點是尼歐怎麼發射信號到母體？因為他的腦電波異於常人？如果是這樣，那第三集尼歐不需要艦艇的發射裝置就可以直接進入母體了，然後開始剷除史密斯，重新塑造母體，並且給人類自由選擇待在母體或者覺醒，創造出一個人類與機器和平共存的新世界，這樣應該頗符合革命的名稱。不過..............還是要看編劇怎麼編啦！