從上面的敘述看來，第一，二集并不是我們所想象的是人和机器的斗爭。其實描述的是机器自身進化的過程，人是有學習進化的能力，机器也有，它利用和研究人類那些目前還不能由机器表達的情感，來進化自身，從而達到更好的控制人類。它建立了Matrix系統給那些平凡的人（占99％），這些人意識里完全接受机器給他們定義的一切。這些人對与机器來說就是電池，沒有別利用价值。另外一些人不接受或不完全接受机器給他們定義的一切，他們的潛意識是free mind.不愿接受一切約束。因而机器同時建立zion系統給這些不平凡的人。讓他們自主意識部分蘇醒，，并受到program的研究。同時給他們一個希望，即通過oracle告訴他們存在一個救世主The one， 他會把他們從机器拯救出來。（多么有諷刺意義，我想大多人都期望有什么救世主），因而可以說這蘇醒的意識依然受程序控制，到一定時候（人的意識太強的時候），Zion就要被消滅。The one回到Matrix的source,升級進化机器。机器成功進行了五次這种輪回。但是正如俗語：終日打鷹，反被鷹啄（机器還不懂這道理）。人的意識, 愿望是如此之強，和不可琢磨，影響The one 6.0， 使The one 6.0做出机器預期不到的選擇。將導致第三集revolution. 推測在第三集Neo真正的蘇醒，同時他拯救了Zion里的人，因為這些人具有free mind的特性，比交容易救。同時因為zion模擬的現實的世界，他們從zion中蘇醒，看到現實的世界比不會太詫异。至于Matrix,　Neo等人也許會和机器達成暫時的妥協，防止Matrix崩潰，而導致里面的人全部滅亡。人類和机器的斗爭并沒結束，而是剛開始。從來都沒有什么救世主。

　　另外，Architect說：“There are levels of survival we are prepared to accept.”意味著Matrix的崩潰并不是所有机器都滅亡。有較高智能的机器也許也象人一樣連接到Matrix系統，當Matrix崩潰，聯系Matrix里的人死亡，從而切斷了能源供應，而導致整個系統的關閉。這些智能机器會pull out from Matrix系統.這些机器只是較少數目，不像Matrix系統那樣龐大，所以不需要太多的能源，也許以前積累下存在電池的能源能足夠這些机器維持生存很長時間。這也許是上面那句話的意義。

或許，在《黑客3》的大結局中，NEO等人醒來，發現自己只是在玩一個虛擬游戲。